Роспотребнадзор России проанализировал научную статью об эволюции нового коронавируса.
Группой авторов (Yvonne CF Su, Danielle E Anderson, Barnaby E Young, Feng Zhu и др.) из Национального центра инфекционных заболеваний и института глобального здоровья Республики Сингапур на сайте 11 марта представлен препринт статьи "Обнаружение делеции 382 пн на ранней стадии эволюции SARS-CoV-2".
Авторы сообщают об открытии ими первой крупной мутации в геноме вируса SARS-CoV-2 за весь период его наблюдения.
В геноме вируса SARS-CoV-2 данная мутация приводит к полному удалению гена Orf8, который играет вспомогательную роль и отличается высокой изменчивостью.
Авторы предполагают, что удаление гена Orf8 из генома вируса SARS-CoV-2 является первым значительным проявлением в адаптации вируса к организму человека.
Они ссылаются на ряд научных статей посвященных эволюции генома вируса SARS вызвавшего вспышку атипичной пневмонии в Китае в 2003-2004 годах.
Геномы вируса SARS на ранних этапах вспышки атипичной пневмонии содержали полный ген Orf8, который также присутствует в геномах почти всех вирусов-предшественников (переносимых летучими мышами и плотоядными животными) установленных для SARS.
В поздней фазе вспышки атипичной пневмонии в выделенных штаммах SARS-CoV ген Orf8 часто отсутствовал целиком с прилегающими к нему областями. Предполагается, что частичная или полная потеря гена Orf8 приводит к уменьшению способности вируса к размножению и ослаблению его заразности.
Авторы статьи предполагают, что выявленная ими полная делеция гена Orf8 у трех вариантов генома вируса SARS-CoV-2, так же является началом радикального изменения свойств этого вируса в процессе его приспособления к организму человека.
Проведенный Роспотребнадзором РФ анализ показал наличие мутации в геноме вируса SARS-CoV-2 только в трех его вариантах, выделенных из клинического материала (17-19 февраля) от пациентов в Сингапуре. Из доступных на сегодня 516 геномов вируса SARS-CoV-2 за период выделения с 24 декабря 2019 по 9 марта 2020 года только в этих трех вариантах генома вируса имеется мутация. В остальных 513 геномах наблюдаются только единичные мутации.
Таким образом, на сегодня нет доказательств дальнейшего эволюционного развития генома вируса SARS-CoV-2 в данном направлении.
